MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.03

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019750	ATT	2	6	38	43	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019750	AAT	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019750	A	9	9	682	690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019750	TAAC	2	8	748	755	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019750	A	7	7	1705	1711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019750	AAC	2	6	2123	2128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019750	TC	3	6	2162	2167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019750	AAG	2	6	2721	2726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019750	CAT	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019750	AAT	2	6	3132	3137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019750	CCA	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_019750	ATTCA	2	10	3408	3417	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019750	TACA	2	8	3470	3477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019750	GAA	2	6	3564	3569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019750	GAG	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019750	TCA	2	6	3642	3647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019750	CAAC	2	8	3679	3686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019750	ATC	2	6	3692	3697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019750	CTA	3	9	3760	3768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019750	ACA	2	6	3769	3774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019750	TGA	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019750	GCA	2	6	3888	3893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019750	A	6	6	3893	3898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019750	TC	3	6	3942	3947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019750	TAG	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019750	A	6	6	3963	3968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019750	AT	3	6	3986	3991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019750	TAAA	2	8	4014	4021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019750	AGT	2	6	4036	4041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019750	AGG	2	6	4067	4072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019750	AAT	2	6	4075	4080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019750	T	6	6	4878	4883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019750	CAA	2	6	4962	4967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019750	TCT	2	6	5021	5026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019750	TAA	2	6	5148	5153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019750	ATT	2	6	5161	5166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019750	ACT	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019750	ACCA	2	8	5219	5226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019750	A	6	6	5263	5268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019750	AAC	2	6	5301	5306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019750	CT	3	6	5309	5314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019750	ATC	2	6	5355	5360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019750	ATAC	2	8	5370	5377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019750	GTG	2	6	9214	9219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019750	GCTGAA	2	12	9261	9272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_019750	TCT	2	6	9324	9329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019750	TAT	2	6	9367	9372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019750	CAAA	2	8	9395	9402	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019750	A	6	6	9436	9441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019750	T	6	6	9465	9470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019750	CAA	2	6	9536	9541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019750	CAA	2	6	9548	9553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019750	GA	3	6	9578	9583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019750	GTAA	2	8	9598	9605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019750	TCAA	2	8	10199	10206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019750	ATT	2	6	10215	10220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019750	GAA	2	6	10225	10230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019750	TGC	2	6	10290	10295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019750	TA	3	6	10315	10320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019750	AAT	3	9	10332	10340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019750	AATA	2	8	10358	10365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019750	ATT	2	6	10568	10573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019750	T	6	6	10639	10644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019750	A	7	7	10681	10687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019750	ATTT	2	8	13745	13752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019750	CAAT	2	8	13827	13834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019750	GAGC	2	8	14250	14257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019750	CTT	2	6	14287	14292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019750	CAA	2	6	14318	14323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019750	AG	3	6	14663	14668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019750	AC	3	6	14671	14676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019750	AAAG	2	8	14683	14690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019750	T	6	6	14723	14728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019750	ATA	2	6	15607	15612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019750	ATT	2	6	15668	15673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019750	AAT	2	6	15712	15717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019750	TC	3	6	15741	15746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019750	TGA	2	6	15761	15766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019750	T	6	6	16723	16728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019750	ATT	2	6	17025	17030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019750	GAA	2	6	17040	17045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019750	AATA	2	8	17053	17060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019750	TAA	2	6	17063	17068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019750	TCC	2	6	18271	18276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_019750	GTA	2	6	18313	18318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019750	A	7	7	18349	18355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019750	T	6	6	18360	18365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019750	CGA	2	6	18372	18377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019750	GT	3	6	20600	20605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019750	CCG	2	6	21692	21697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_019750	GTT	2	6	25448	25453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019750	AGC	2	6	25462	25467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019750	A	6	6	25486	25491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019750	AT	3	6	27451	27456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019750	ATT	2	6	27472	27477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019750	ATT	2	6	27489	27494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019750	CTTCA	2	10	27514	27523	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_019750	AAT	2	6	27554	27559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019750	TCT	2	6	27566	27571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019750	TTA	2	6	27597	27602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019750	ACC	2	6	27611	27616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019750	AGC	2	6	28123	28128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019750	TTC	2	6	28139	28144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019750	AAAC	2	8	28194	28201	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019750	CAAC	2	8	28221	28228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019750	TCCCA	2	10	28233	28242	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_019750	ACTT	2	8	28250	28257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019750	GAG	2	6	28280	28285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019750	TTGG	2	8	28301	28308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019750	GCA	2	6	28396	28401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019750	TCG	2	6	28408	28413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019750	AAT	2	6	28480	28485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019750	GAG	2	6	28519	28524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019750	TAA	2	6	28754	28759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019750	ACA	2	6	28789	28794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019750	CAA	2	6	28826	28831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019750	ATTCG	2	10	28866	28875	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_019750	GTTT	2	8	28988	28995	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019750	CTTT	2	8	29025	29032	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019750	TGTT	2	8	30105	30112	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019750	T	6	6	30160	30165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019750	ACT	2	6	30194	30199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019750	TGAT	2	8	30202	30209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019750	A	6	6	30275	30280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019750	CT	3	6	30284	30289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019750	TA	3	6	30335	30340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019750	CAA	2	6	30364	30369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019750	TTAT	2	8	30395	30402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019750	CT	3	6	30404	30409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019750	TTTA	2	8	31054	31061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019750	A	6	6	31066	31071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019750	AC	3	6	31081	31086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019750	TAC	2	6	31088	31093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019750	GTAA	2	8	31134	31141	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019750	TTG	2	6	31146	31151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019750	TCT	2	6	31204	31209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019750	CTT	2	6	31214	31219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019750	T	6	6	31327	31332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019750	GTA	2	6	31359	31364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019750	CAA	2	6	31370	31375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019750	TCGC	2	8	31517	31524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019750	TCC	2	6	31567	31572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_019750	TCA	2	6	31584	31589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_019750	ATTCG	2	10	31610	31619	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_019750	TCC	2	6	31629	31634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_019750	A	7	7	31699	31705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019750	CTT	2	6	31759	31764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_019750	TGA	2	6	31765	31770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019750	TTC	2	6	34020	34025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_019750	AAGAG	2	10	34087	34096	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019750	TTAAA	2	10	34220	34229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019750	AC	3	6	34279	34284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_019750	GTTTT	2	10	34290	34299	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019750	TTG	2	6	34322	34327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019750	TCC	2	6	34375	34380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_019750	ACG	2	6	34386	34391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_019750	CAC	2	6	34409	34414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_019750	ATTA	2	8	34434	34441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_019750	TCT	2	6	35612	35617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_019750	CTCG	2	8	37763	37770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
161	NC_019750	TAG	2	6	37791	37796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_019750	TAC	2	6	37804	37809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_019750	GAC	2	6	39216	39221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_019750	TAA	2	6	39230	39235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_019750	GCT	2	6	39970	39975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_019750	TTA	2	6	40007	40012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_019750	A	6	6	40023	40028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_019750	T	7	7	40030	40036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_019750	ATT	2	6	40068	40073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_019750	ATT	2	6	40098	40103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_019750	A	7	7	40151	40157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_019750	AAAC	2	8	40198	40205	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
173	NC_019750	ATTTA	2	10	40217	40226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_019750	AAT	2	6	40229	40234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_019750	TAA	2	6	40238	40243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_019750	CAC	2	6	40846	40851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_019750	CAAC	2	8	40861	40868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
178	NC_019750	AAAC	2	8	42834	42841	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
179	NC_019750	CCAG	2	8	42846	42853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
180	NC_019750	CTA	2	6	42881	42886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_019750	TCA	2	6	46639	46644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_019750	TTCA	2	8	46653	46660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
183	NC_019750	GTA	3	9	46688	46696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_019750	CTA	2	6	46722	46727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_019750	CTG	2	6	46767	46772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_019750	TAAGT	2	10	46785	46794	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_019750	TAA	2	6	46815	46820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_019750	TTAG	2	8	47550	47557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
189	NC_019750	CCT	2	6	48047	48052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
190	NC_019750	TAAA	2	8	48064	48071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_019750	ATG	2	6	48109	48114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
192	NC_019750	CTGCC	2	10	48153	48162	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
193	NC_019750	TTTA	2	8	48562	48569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_019750	AAAT	2	8	48573	48580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_019750	T	6	6	48607	48612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_019750	ACT	2	6	50220	50225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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198	NC_019750	ATG	2	6	50796	50801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
199	NC_019750	CT	3	6	50845	50850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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201	NC_019750	TA	3	6	50886	50891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_019750	TAA	2	6	50957	50962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_019750	A	7	7	66698	66704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_019750	TAA	2	6	67153	67158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_019750	A	6	6	67243	67248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_019750	CACT	2	8	67378	67385	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
264	NC_019750	CCCCA	2	10	67386	67395	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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269	NC_019750	TGT	3	9	67490	67498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_019750	TAT	2	6	67505	67510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.